马祖国家风景区於1988年11月26日正式成立，范围包含南竿、北竿、东莒、西莒、东引、亮岛、高登、大丘、小丘还有许多无人岛屿，形成东西窄、南北狭长之地形，其中以南竿为第一大岛，为马祖的政经文教中心。马祖旧名南竿塘，宋朝年间，福建省莆田县湄州岛的林默娘投海寻父，尸首漂至岛上，乡人为纪念并彰扬其孝行，尊为妈祖，立庙祭祀，并取其谐音”马祖”作为列岛总名。马祖诸岛都有其可观之处，南竿有天后宫、北海坑道、马祖酒厂，北竿有壁山、塘沃海滩，东引有酒厂、灯塔。